De VOC was in zijn tijd een omvangrijke en complexe organisatie. De op deze website geboden informatie bestrijkt dan ook slechts een deel van de rijk geschakeerde werkelijkheid.

Het VOC-Kenniscentrum was oorspronkelijk een project van het Koninklijk Instituut voor Taal-, Land- en Volkenkunde (KITLV). Per 1 juli 2014 is de website overgenomen door het Huygens Instituut voor Nederlandse Geschiedenis, een instituut van de Koninklijke Nederlandse Akademie van Wetenschappen (KNAW).

Het VOC-Kenniscentrum werd gesubsidieerd door de Stichting Viering 400 jaar VOC.