Het archief is onderverdeeld naar de vier directies van Amsterdam, Hoorn, Rotterdam en Middelburg. De onderdelen bevatten de gebruikelijke onderdelen van resoluties en correspondentie. Daarnaast bevat het archief van de directie Amsterdam onder andere een commissieboek 1625-1800 en financiële gegevens betreffende de lastgelden en betreffende de vestigingen in de Levant. De directie Rotterdam heeft 322 een algemene index op het eigen archief. In elk van de onderdelen bevinden zich gegevens over de algemene vergaderingen te Amsterdam.

• Directie van de Levantse Handel