Zoekmiddelen: De zogenaamde "Groene indices" op dit archief bevinden zich in het archief van de Staatssecretarie van Lodewijk Napoleon, toegang 2.01.01.07, 548 en 549 en de concept-index 576. Aldaar ook de secrete index van de Raadpensionaris, 564 en de generale expeditielijsten 608-612. In het Archief van de Raadpensionaris is 29 bis een Register van publikaties van Hun Hoog Mogenden Vertegenwoordigende het Bataafsch Gemeenebest, van 29 april tot 31 december 1805, met net-afschriften van alle publikaties. Eenzelfde register voor 1806 in 92, met een klapper op alle publicaties van 1795 tot 1806. 96 is de secrete agenda april 1805 - juni 1806.

Besluiten: 1-26 minuut Staatsbesluiten.

Correspondentie: 27-29 minuten van uitgaande missiven. De ingekomen stukken, 30-81, zijn ingedeeld volgens afzender, met daarnaast 82-86 de in advies gehouden stukken.

Geheim: minuten van de secrete Staatsbesluiten, 87 - 88 en 89 Secrete Staatsbesluiten. 90 en 91 secrete relatieven. Kopie van de secrete correspondentie van de Raadpensionaris, 6 februari - 6 juli 1806 in 45B.

Diversen: In 45 Stukken betreffende de benoeming van Lodewijk Napoleon tot Koning van Holland, februari-juli 1806. Behalve commissorialen en secrete expeditielijsten is er ook nr 98 een alfabetisch register op de verleende paspoorten.

• Algemene Secretarie van Staat
• Commissaris tot de Gecedeerde Landen aan de Bataafse republiek
• Raadpensionaris